Lynæs opstod efter Kikhavns brand i 1793 og er det næstældste fiskerleje på Halsnæs. Som navnet siger ligger det i ly af de høje bakker yderst på næsset. I forrige århundrede var fiskeriet fra den idylliske havn på sit højeste, herfra gik færgen til Rørvig og der var dampskibsforbindelse til Frederikssund og Nykøbing langt op i det 20. århundrede. Nu ligger de fleste fiskekuttere i Hundested havn som også har overtaget færgeforbindelsen til Rørvig. I dag er Lynæs en moderne lystbådehavn.

I dag er Lynæs en moderne lystbådehavn, der giver adgang til både Isefjorden, Roskilde Fjord og videre ud i Kattegat. Havnen, der er beliggende kun tre kilometer fra Hundested, besøges flittigt af lystsejlere.

Denne lokation er blevet brugt i følgende film
Flådens friske fyre (1965)